研究キーワード	research interests

研究分野	research research_areas

学歴	education	2005年04月 － 2010年03月 東京海洋大学 海洋科学技術研究科 2001年04月 － 2005年03月 東京水産大学 水産学部 2005/04 － 2010/03 Tokyo University of Marine Science and Technology Graduate School of Marine Science and Technology 2001/04 － 2005/03 Tokyo University of Fisheries Faculty of Fisheries

経歴	experience	2020年08月 － 長崎大学 大学院水産・環境科学総合研究科 准教授 2017年04月 － 2020年07月 東京大学 大学院農学生命科学研究科 特任研究員 2014年04月 － 2017年03月 東京大学 大学院農学生命科学研究科 日本学術振興会特別研究員（PD） 2011年08月 － 2014年03月 東京海洋大学 大学院海洋科学技術研究科 博士研究員 2010年05月 － 2011年06月 エモリー大学 生物学科 博士研究員 2020/08 － Nagasaki University Graduate School of Fisheries Science and Environmental Studies Associate Professor 2017/04 － 2020/07 The University of Tokyo Graduate School of Agricultural and Life Sciences Postdoctoral Fellow 2014/04 － 2017/03 The University of Tokyo Graduate School of Agricultural and Life Sciences JSPS Postdoctoral Fellow (PD) 2011/08 － 2014/03 Tokyo University of Marine Science and Technology Graduate School of Marine Science and Technology Postdoctoral Fellow 2010/05 － 2011/06 Emory University Department of Biology Postdoctoral Fellow

委員歴	committee memberships

所属学協会	association memberships

受賞	awards

論文	papers	Comparative Analysis of Genetic Structure and Diversity in Five Populations of Yellowtail Kingfish (Seriola aureovittata) Aijun Cui,Yongjiang Xu,Kiyoshi Kikuchi,Yan Jiang,Bin Wang,Takashi Koyama,Xuezhou Liu Journal of Marine Science and Engineering 11巻8号1583頁-1583頁 2023年08月12日 Revisiting the Role of Steroid Hormones in Gonadal Fate Determination Kiyoshi Kikuchi,Takashi Koyama Spectrum of Sex 87頁-110頁 2022年11月08日 Effects of low fishmeal diets on growth performance, blood chemical composition, parasite resistance, and gene expression in the tiger pufferfish, Takifugu rubripes Zijie Lin,Sota Yoshikawa,Masaomi Hamasaki,Takashi Koyama,Kiyoshi Kikuchi,Sho Hosoya Aquaculture 560巻738484頁-738484頁 2022年11月 Repeated translocation of a supergene underlying rapid sex chromosome turnover in Takifugu pufferfish. Ahammad Kabir,Risa Ieda,Sho Hosoya,Daigaku Fujikawa,Kazufumi Atsumi,Shota Tajima,Aoi Nozawa,Takashi Koyama,Shotaro Hirase,Osamu Nakamura,Mitsutaka Kadota,Osamu Nishimura,Shigehiro Kuraku,Yasukazu Nakamura,Hisato Kobayashi,Atsushi Toyoda,Satoshi Tasumi,Kiyoshi Kikuchi Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119巻23号e212146911頁- 2022年06月07日 Single-cell RNA-seq analysis reveals penaeid shrimp hemocyte subpopulations and cell differentiation process Keiichiro Koiwai,Takashi Koyama,Soichiro Tsuda,Atsushi Toyoda,Kiyoshi Kikuchi,Hiroaki Suzuki,Ryuji Kawano eLife 10巻 2021年01月10日 Capacity for freshwater acclimation and differences in the transcription of ion transporter genes underlying different migratory life histories of Takifugu fish Masahiro Nakamura,Tao Jiang,Gangchun Xu,Jian Yang,Pao Xu,Soichi Watanabe,Toyoji Kaneko,Takashi Koyama,Kiyoshi Kikuchi,Katsumi Tsukamoto,Tsuguo Otake Gene 767巻145285頁-145285頁 2021年01月 Ⅰ-3. ブリ属魚類の性決定機構 小山 喬,中本 正俊,森島 輝,山下 雄史,水野 直樹,菊池 潔,坂本 崇 日本水産学会誌 85巻2号188頁-188頁 2019年 I-2. Sex-determining genes in Takifugu pufferfishes Kikuchi, K.,Ieda, R.,Fujikawa, D.,Ahammad, K.,Koyama, T.,Hosoya, S. Nippon Suisan Gakkaishi (Japanese Edition) 85巻2号187頁-187頁 2019年 A SNP in a Steroidogenic Enzyme Is Associated with Phenotypic Sex in Seriola Fishes Koyama, T.,Nakamoto, M.,Morishima, K.,Yamashita, R.,Yamashita, T.,Sasaki, K.,Kuruma, Y.,Mizuno, N.,Suzuki, M.,Okada, Y.,Ieda, R.,Uchino, T.,Tasumi, S.,Hosoya, S.,Uno, S.,Koyama, J.,Toyoda, A.,Kikuchi, K.,Sakamoto, T. Current Biology 29巻11号1901頁-1909頁 2019年 Identification of the sex-determining locus in grass puffer (Takifugu niphobles) provides evidence for sex-chromosome turnover in a subset of Takifugu species Ieda, R.,Hosoya, S.,Tajima, S.,Atsumi, K.,Kamiya, T.,Nozawa, A.,Aoki, Y.,Tasumi, S.,Koyama, T.,Nakamura, O.,Suzuki, Y.,Kikuchi, K. PLoS ONE 13巻1号e0190635頁- 2018年 Comparative Analysis of Genetic Structure and Diversity in Five Populations of Yellowtail Kingfish (Seriola aureovittata) Aijun Cui,Yongjiang Xu,Kiyoshi Kikuchi,Yan Jiang,Bin Wang,Takashi Koyama,Xuezhou Liu Journal of Marine Science and Engineering 11.8.1583-1583 2023/08/12 Revisiting the Role of Steroid Hormones in Gonadal Fate Determination Kiyoshi Kikuchi,Takashi Koyama Spectrum of Sex 87-110 2022/11/08 Effects of low fishmeal diets on growth performance, blood chemical composition, parasite resistance, and gene expression in the tiger pufferfish, Takifugu rubripes Zijie Lin,Sota Yoshikawa,Masaomi Hamasaki,Takashi Koyama,Kiyoshi Kikuchi,Sho Hosoya Aquaculture 560.738484-738484 2022/11 Repeated translocation of a supergene underlying rapid sex chromosome turnover in Takifugu pufferfish. Ahammad Kabir,Risa Ieda,Sho Hosoya,Daigaku Fujikawa,Kazufumi Atsumi,Shota Tajima,Aoi Nozawa,Takashi Koyama,Shotaro Hirase,Osamu Nakamura,Mitsutaka Kadota,Osamu Nishimura,Shigehiro Kuraku,Yasukazu Nakamura,Hisato Kobayashi,Atsushi Toyoda,Satoshi Tasumi,Kiyoshi Kikuchi Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119.23.e212146911- 2022/06/07 Single-cell RNA-seq analysis reveals penaeid shrimp hemocyte subpopulations and cell differentiation process Keiichiro Koiwai,Takashi Koyama,Soichiro Tsuda,Atsushi Toyoda,Kiyoshi Kikuchi,Hiroaki Suzuki,Ryuji Kawano eLife 10. 2021/01/10 Capacity for freshwater acclimation and differences in the transcription of ion transporter genes underlying different migratory life histories of Takifugu fish Masahiro Nakamura,Tao Jiang,Gangchun Xu,Jian Yang,Pao Xu,Soichi Watanabe,Toyoji Kaneko,Takashi Koyama,Kiyoshi Kikuchi,Katsumi Tsukamoto,Tsuguo Otake Gene 767.145285-145285 2021/01 I-3. Sex determination mechanism in Seriola fishes Koyama, T.,Nakamoto, M.,Morishima, K.,Yamashita, T.,Mizuno, N.,Kikuchi, K.,Sakamoto, T. Nippon Suisan Gakkaishi (Japanese Edition) 85.2.188-188 2019 I-2. Sex-determining genes in Takifugu pufferfishes Kikuchi, K.,Ieda, R.,Fujikawa, D.,Ahammad, K.,Koyama, T.,Hosoya, S. Nippon Suisan Gakkaishi (Japanese Edition) 85.2.187-187 2019 A SNP in a Steroidogenic Enzyme Is Associated with Phenotypic Sex in Seriola Fishes Koyama, T.,Nakamoto, M.,Morishima, K.,Yamashita, R.,Yamashita, T.,Sasaki, K.,Kuruma, Y.,Mizuno, N.,Suzuki, M.,Okada, Y.,Ieda, R.,Uchino, T.,Tasumi, S.,Hosoya, S.,Uno, S.,Koyama, J.,Toyoda, A.,Kikuchi, K.,Sakamoto, T. Current Biology 29.11.1901-1909 2019 Identification of the sex-determining locus in grass puffer (Takifugu niphobles) provides evidence for sex-chromosome turnover in a subset of Takifugu species Ieda, R.,Hosoya, S.,Tajima, S.,Atsumi, K.,Kamiya, T.,Nozawa, A.,Aoki, Y.,Tasumi, S.,Koyama, T.,Nakamura, O.,Suzuki, Y.,Kikuchi, K. PLoS ONE 13.1.e0190635- 2018 さらに表示する more

MISC

単細胞レベルでのクルマエビ血球細胞の機能および分化経路推定 小祝敬一郎,小山喬,津田宗一郎,豊田敦,菊池潔,鈴木宏明,川野竜司 日本水産学会大会講演要旨集(CD-ROM) 2021巻 2021年 マイクロ流路チップを用いた水産生物の細胞解析 小祝敬一郎,村上友樹,鈴木宏明,小山喬,菊池潔,豊田敦,津田宗一郎 日本水産学会大会講演要旨集 2020巻 2020年 クサフグで生じた性的拮抗の解消 藤川大学,家田梨櫻,AHAMMAD Kabir,小山喬,細谷将,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2019巻 2019年 ステロイド代謝酵素多型によるブリ属の遺伝的性決定機構 小山喬,中本正俊,森島輝,山下量平,山下雄史,佐々木皓平,水野直樹,車遥介,鈴木萌,家田梨櫻,内野翼,田角聡志,細谷将,宇野誠一,小山次朗,豊田敦,菊池潔,坂本崇 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st巻 2018年 クサフグ性決定遺伝子の探索-少数個体を用いたGWASの発見的利用- 家田梨櫻,小山喬,細谷将,大木駿,水野直樹,藤田真志,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2018巻 2018年 ショウサイフグ性決定遺伝子の探索-Pool-seqによる表現型原因遺伝子の特定- 家田梨櫻,細谷将,小山喬,城夕香,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2018巻 2018年 ブリ属の性決定遺伝子はステロイド代謝酵素である 小山喬,森島輝,山下量平,豊田敦,内野翼,坂本崇,鈴木萌,細谷将,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2018巻 2018年 トランスクリプトーム解析による淡水適応関連遺伝子の探索 伊藤洸太朗,中村政裕,藤田真志,小山喬,田角聡志,細谷将,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2016巻 2016年 ショウサイフグが獲得した新しい性決定遺伝子座の解析 家田梨櫻,青木勇磨,中村修,小林久人,城夕香,小山喬,細谷将,田角聡志,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2016巻 2016年 性染色体初期進化の実験モデルとしてのブリ類の有用性 小山喬,吉田一範,尾崎照遵,青木純哉,荒木和男,細谷将,菊池潔,坂本崇 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 17th巻 2015年 小祝敬一郎,小山喬,津田宗一郎,豊田敦,菊池潔,鈴木宏明,川野竜司 日本水産学会大会講演要旨集(CD-ROM) 2021. 2021 小祝敬一郎,村上友樹,鈴木宏明,小山喬,菊池潔,豊田敦,津田宗一郎 日本水産学会大会講演要旨集 2020. 2020 藤川大学,家田梨櫻,AHAMMAD Kabir,小山喬,細谷将,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2019. 2019 小山喬,中本正俊,森島輝,山下量平,山下雄史,佐々木皓平,水野直樹,車遥介,鈴木萌,家田梨櫻,内野翼,田角聡志,細谷将,宇野誠一,小山次朗,豊田敦,菊池潔,坂本崇 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st. 2018 家田梨櫻,小山喬,細谷将,大木駿,水野直樹,藤田真志,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2018. 2018 家田梨櫻,細谷将,小山喬,城夕香,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2018. 2018 小山喬,森島輝,山下量平,豊田敦,内野翼,坂本崇,鈴木萌,細谷将,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2018. 2018 伊藤洸太朗,中村政裕,藤田真志,小山喬,田角聡志,細谷将,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2016. 2016 家田梨櫻,青木勇磨,中村修,小林久人,城夕香,小山喬,細谷将,田角聡志,菊池潔 日本水産学会大会講演要旨集 2016. 2016 小山喬,吉田一範,尾崎照遵,青木純哉,荒木和男,細谷将,菊池潔,坂本崇 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 17th. 2015 さらに表示する more

書籍等出版物	books	Spectrum of sex : the molecular bases that induce various sexual phenotypes 田中, 実 (生物学),立花, 誠 Springer Nature Singapore 2022年 9789811953583 魚類の性決定・性分化・性転換 : これまでとこれから = Sex Determination,Sex Differentiation and Sex Change in Fishes:Past,Present and Future 日本水産学会,菊池, 潔,井尻, 成保,北野, 健 恒星社厚生閣 2021年03月 9784769916635 魚類の性決定・性分化・性転換 : これまでとこれから = Sex determination, sex differentiation and sex change in fishes-past, present and future 菊池, 潔,井尻, 成保,北野, 健,日本水産学会 [恒星社厚生閣] 2021年03月 Spectrum of sex : the molecular bases that induce various sexual phenotypes 田中, 実 (生物学),立花, 誠 Springer Nature Singapore 2022 9789811953583 魚類の性決定・性分化・性転換 : これまでとこれから = Sex Determination,Sex Differentiation and Sex Change in Fishes:Past,Present and Future 日本水産学会,菊池, 潔,井尻, 成保,北野, 健 恒星社厚生閣 2021/03 9784769916635 魚類の性決定・性分化・性転換 : これまでとこれから = Sex determination, sex differentiation and sex change in fishes-past, present and future 菊池, 潔,井尻, 成保,北野, 健,日本水産学会 [恒星社厚生閣] 2021/03

講演・口頭発表等	conference

担当経験のある項目	teaching experience

Works

競争的資金等の研究課題	research grants	宿主体液中の遺伝子発現情報を利用した早期魚病診断法の確立 公益財団法人Konno＆レスター財団 農林水産業における革新的・先進的技術に関する研究【2026年度】 2026年04月 - 2028年03月 研究代表者 黒潮流域におけるカンパチの集団構造：バイオロギングと分子系統による統合解析 日本学術振興会 科学研究費助成事業 2025年04月 - 2028年03月 ブリ性拮抗選択を遺伝子発現レベルで可視化する 公益財団法人 武田科学振興財団 ライフサイエンス研究助成（2022年度） 2022年09月 - 2027年03月 研究代表者 体液由来細胞外遊離RNAを用いて非侵襲的な早期魚病診断法を開発する ～２．感染段階分類能の評価と向上～ 公益財団法人G-7奨学財団 令和7年度秋季公募 研究開発助成事業 2026年01月 - 2026年12月 研究代表者 水産資源種ヒラマサの繁殖生態の解明 日本学術振興会 科学研究費助成事業 2023年04月01日 - 2026年03月31日 リキッドバイオプシーによる早期魚病診断法の確立 一般社団法人ヤンマー資源循環支援機構 2025年度 助成事業（研究）一般 2025年04月 - 2026年03月 研究代表者 体液由来小分子RNAを用いて非侵襲的な超早期魚病 診断法を実現する 公益財団法人ロッテ財団 奨励研究助成A 2023年04月 - 2026年03月 研究代表者 急速な進化を逆利用して水産生物の性決定遺伝子をとらえる 日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(A) 2022年04月 - 2026年03月 研究分担者 体液由来細胞外遊離RNAを用いて非侵襲的な早期魚病診断法を開発する 公益財団法人G-7奨学財団 令和6年度秋季公募 研究開発助成事業 2025年01月 - 2025年12月 研究代表者 小分子RNAを活用した新たな魚病対策法確立の試み 日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 2022年04月 - 2025年03月 研究代表者 宿主体液中の遺伝子発現情報を利用した早期魚病診断法の確立 公益財団法人Konno＆レスター財団 農林水産業における革新的・先進的技術に関する研究【2026年度】 2026/04 - 2028/03 principal_investigator 黒潮流域におけるカンパチの集団構造：バイオロギングと分子系統による統合解析 日本学術振興会 科学研究費助成事業 2025/04 - 2028/03 NA Takeda Science Foundation ライフサイエンス研究助成（2022年度） 2022/09 - 2027/03 principal_investigator NA G-7 Scholarship Foundation 令和7年度秋季公募 研究開発助成事業 2026/01 - 2026/12 principal_investigator Reproductive ecology of Seriola lalandi Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research 2023/04/01 - 2026/03/31 NA 一般社団法人ヤンマー資源循環支援機構 2025年度 助成事業（研究）一般 2025/04 - 2026/03 principal_investigator NA LOTTE Foundation NA 2023/04 - 2026/03 principal_investigator 急速な進化を逆利用して水産生物の性決定遺伝子をとらえる Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A) 2022/04 - 2026/03 coinvestigator NA G-7 Scholarship Foundation 令和6年度秋季公募 研究開発助成事業 2025/01 - 2025/12 principal_investigator Establishment of clinical diagnosis on fish disease using small RNA Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C) 2022/04 - 2025/03 principal_investigator さらに表示する more

特許	patents	ブリ類の性識別方法 坂 本 崇,中 本 正 俊,菊 池 潔,小 山 喬 特願2018-027260 2018年02月19日 ブリ類の性識別方法 坂 本 崇,中 本 正 俊,菊 池 潔,小 山 喬 特願2018-027260 2018年02月19日 ブリ類の性識別方法 坂本 崇,小山 喬,尾崎 照遵,荒木 和男,吉田 一範,津崎 龍雄 特願2013-055979 2013年03月19日 ブリ類の性識別方法 坂本 崇,小山 喬,尾崎 照遵,荒木 和男,吉田 一範,津崎 龍雄 特願2013-055979 2013年03月19日 ブリ類の性識別方法 坂 本 崇,中 本 正 俊,菊 池 潔,小 山 喬 特願2018-027260 2018/02/19 ブリ類の性識別方法 坂 本 崇,中 本 正 俊,菊 池 潔,小 山 喬 特願2018-027260 2018/02/19 ブリ類の性識別方法 坂本 崇,小山 喬,尾崎 照遵,荒木 和男,吉田 一範,津崎 龍雄 特願2013-055979 2013/03/19 ブリ類の性識別方法 坂本 崇,小山 喬,尾崎 照遵,荒木 和男,吉田 一範,津崎 龍雄 特願2013-055979 2013/03/19

社会貢献活動	social contribution

メディア報道	media_coverage

学術貢献活動	academic_contribution

その他	etc